3Scan---一家创新性病理学创业公司 能进行超高分辨率的3D组织成像
2015-02-05 3Scan 奇点网
图片来源3Scan网站奇点微信号：geekheal_com旧金山湾区医疗创业公司3Scan正在研发一个超高分辨率的3D组织成像平台，可创建整个基因组测序级别的数据量。3Scan刚刚在新一轮融资中获得670万美元投资，由Lux Capital
图片来源3Scan网站
旧金山湾区医疗创业公司3Scan正在研发一个超高分辨率的3D组织成像平台，可创建整个基因组测序级别的数据量。
3Scan刚刚在新一轮融资中获得670万美元投资，由Lux Capital领投。之前，3Scan从Breakout Labs获得约35万美元投资，还在种子轮融资中获得150万美元投资。
3Scan能为研究人员，尤其是病理学专家，提供分辨率极高的3D组织结构图像。其“刀刃扫描电子显微镜”(以下简称“KESM”)能自动对组织进行切片和成像，然后给出超高分辨率的数据：每立方厘米一万亿字节(1TB)。
3Scan CEO托德·霍夫曼称(Todd Huffman)称：“最近几年，医疗科学取得了令人难以置信的进步，但解剖病理学仍维持在19世纪的水平。”
病理学一门实践性很强的学科：一旦组织样品送到实验室，研究人员需要对其切片，保存在福尔马林中，然后染色。该过程需要几天时间，之后再用显微镜进一步检查细胞病变。
相比之下，3Scan对组织的切片和成像都是在对原始组织的自动化和数字化操作下完成的，没有人为因素影响整个过程。且是基于整个器官的高度对组织切片进行分析。霍夫曼说：“切片和成像完全是自动化过程。由于无需人工干预，我们对组织的分析速度提高了100倍。”
霍夫曼说，许多疾病体现在组织和器官层面上，因此传统的显微镜可能无法提供像我们这样的全组织分析所提供的结果。例如，如果拥有肿瘤的微血管3D图像，就能够告诉我们药物的作用结果。
霍夫曼还称，要检查更大的组织切片，传统的分析方法是进行高分辨率的核磁共振和CT扫描，但这些达不到光学显微镜的聚焦水平。而KESM每小时能处理3600个切片，能对整个老鼠大脑组织成像。
KESM采用金刚石刀刃，有双重用途：一是切片，二是照明。对组织切片后，然后照亮，紧接着用照相机对每一个切片进行拍照。
该领域的其他公司还包括Leica Biosystems，2013年曾利用类似的技术对爱因斯坦大脑横截面照片进行了数字化。但到目前为止，这两家公司的技术尚未应用于临床。
霍夫曼说：“临床之前还有许多事情要做，尤其是在计算方面。对于基因组测序所产生的数据，我们需要创建一个全新的生物信息学领域。同样，要了解这些3D组织数据，还有许多工作要做。”
当前，3Scan的努力主要集中在帮助科学家进行一些基本的疾病研究，药物发现和组织结构的筛选。
霍夫曼说：“一个人不可能查看1TB的图像，我们必须要开发出新的算法和技术来识别它们。”霍夫曼还称，去年夏天他们已经向凯特琳大学(Kettering University)售出了第一台设备。
文章原标题：Big data in pathology： 3Scan's 3D tissue imaging platform offers reams of data on scale of gene sequencing
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