为什么不建议你给导师回复“收到”,这是我听过最好的答案!

2022-12-19 熊猫放射 熊猫放射 发表于安徽省

工欲善其事,必先利其器。大数据时代,医学人想要如鱼得水,学会Python应当提上日程。

最近,收到很多朋友的留言:

“有次导师布置任务,回复‘收到’竟被痛批了一顿.....

“工作太忙,经常要查房、写病例,好不容易挤出时间,准备做些临床科研,却被密密麻麻的数据,折磨得面目全非。

别人的文献库那么丰富,而自己的却像沼泽,吞噬了大量精力却颗粒无收,真的很绝望。

难道就只有被虐的份吗?”

当然不是了。

今天就借我一个朋友的故事,来聊聊临床科研这件事。

01

医学人的痛,都是它惹的祸

安然是医学研二,平常既要在医院轮转,还要抽出时间做科研,为此饱受折磨。

下班后,她才拿出厚厚的资料,经常爆肝到深夜。

这个繁琐的过程,需要一点点的分类和统计,各个Excel来回切换,弄得她头晕眼花,还要时刻保持专注,生怕数据录入错误,影响最终的结论。

坚持了半年时间,终于收集到了足够的样本。

到了分析环节,她打开整理好的数据,一点点筛选、统计、分类, nomogram、GEE、PSM,预测模型换了一个又一个,终于得出了结论。

谁知将论文交上去之后,却换来导师的一阵批斗:

❶ 病历筛选无逻辑,部分数据未定量;

❷ 数据不能支撑结论,需要重新核验;

❸ 实验数据没有可视化,密密麻麻看不清;

同专业有个学长,1年发表了5篇SCI,还有1篇一区论文,登上学校荣誉榜,是很多人膜拜对象

安然去找他请教。学长直接甩出他的神器:Python。

直接输了少量代码,不到1杯茶工夫,1天的临床数据就自动录入、分类、整理好了,碰到异常数据,还能自动校正,人力根本无法比拟。

  文献精准筛选和下载  

最让人头疼的文献,用Python 3秒就能定位,5分钟一并下载相关领域的关键文章、重要作者和科研热点,追溯引证关系。

还能轻松获取到国内外医学研究的最新进展,帮自己掌握最前沿的医学知识。

爬取小众精致的 PPT 、海报等模板。

日常病历汇报、述职报告、学术交流等,都要制作各类PPT,虽然都是已知信息的罗列,却要耗费大量的时间。

Python能自动获取相关信息,匹配对应PPT模板,1分钟自动生成各类PPT,日常汇报和陈述,打开就能直接用。

   文件格式转换  

大家平时对文献的PDF转Word有需求的应该不在少数,python对于文字PDF和PDF扫描件转换速度都非常快,而且精准,解决了很多人的困惑。

△一键下载、自动翻译外文文献

 自动提取数据指标 

面对厚厚的临床资料,用python不到1杯茶的工夫,就能自动录入、分类、整理好了,碰到异常数据,还能自动校正、报错等,人力根本无法比拟。

像医院的HIS系统、档案库中的数据,Python也能轻松获取。

   病例自动导入 

研究各种疾病课题,需要收集几千例患者样本,几行代码后,原本繁杂的病例竟然自动提取到了系统当中。整个样本数据从导入到清洗完成,只用了不到1天!

最新的病历和研究成果,很难在临床就诊中应用。

Python能自动爬取全网文献信息,根据病人临床数据,自动爬取最新文献及研究成果,帮助你更加精准的做成判断。还能自动清洗,一键剔除用不到的。

  可视化图表  

处理了凌乱的临床数据之后,还能直接提取关键数据,生成可视化图表,直观展示千辛万苦得来的研究成果,助力文章发表。

这么轻松!论文科研的突破口这就不攻自破了?

  医学影像辅助诊断  

对血透医生来说,影像诊断需要保持高度专注,诊断效率慢不说,肉眼观察容易出现漏看的情况。

用Python做一个医学影像诊断工具,自动比对影像信息,发现异常自动提示,并给出相应的结论,防止错看和漏看的情况,轻松的诊断并找到问题。

 医学影像智能处理 

经常要对CT、造影进行读片,例如病变的识别和分割,但人眼精度有限。写一个图像处理程序,逐层分割出核心病理特征,从而更快判断出病人情况。

  精准翻译国外文献  

还可以用它做一个自动翻译的小工具,将爬取到的外文文献自动翻译成中文。

并且把翻译下载好的文件进行归类,存放到指定的位置。大大节省了我们自己去网站翻译的时间。:smirking_face:

  爬招考信息和题库  

第一时间获取全网招考信息,比如各类执业医证、考公考编、考研,第一时间、不错过任何优质岗位,爬取全网历年招聘考试题库和高频考点、学校信息效率也是极高!

“怪不得学长天天不慌不忙的,论文倒是发了好几篇。要是早点知道用这个查文献、做数据,我也不至于这么煎熬了!“

于是她迅速学起了Python。发牢骚的深夜语音消失了,取而代之的是她满是兴奋的动态:

审稿专家那边过了,调整下格式就能发刊!

我用Python搜集整合了许多导师需要的资料,她现在对我刮目相看;

不仅导师夸我,同学们也来向我请教,成就感满满啊!

听说,她用Python自动下载翻译了国外文献,截图发到校友群里,竟然有同学问她:能不能卖一份给我?

看来Python的确是个神器!

02

医学人,千万别打杂。

很多人抱着一腔热血报读医学专业,结果发现最痛苦的不是枯燥实验,而是在浩如烟海的资料中手忙脚乱。

掌握一个帮你打杂的工具太重要了。这样才能把精力集中在科研本身。

近几年Python流行起来,也正是因为它在资料收集、数据分析方面实在强势,只需要几行简短的代码,它就可以:

● 网络爬虫,一键爬取全网公开资料

● 对实验结果进行数据分析,让观点更科学严谨

● 批量处理上百个Excel、Word、PDF文件

● 生成可视化图表,成果展示更专业……

它几乎已经成了医学圈大佬人手必备的工具。4月份复旦博士生用Python,为班级写出了“核算报告自动核查”的程序。

800幅截图,原来要几个人核对一个多小时,现在只需等2分钟就拿到结果。

如果今天是你第一次了解Python,那么该有点危机感了。

如今AI已经应用于医学的各个领域,《柳叶刀》上有非常多研究报告,都是用AI自动数据分析的方式得出的。

这也意味着,未来AI将辅助医生工作的方方面面,Python也会成为新时代医生的“标配”。

很多医院和科研机构的招聘,都已经注明:掌握Python优先。

 

工欲善其事,必先利其器。大数据时代,医学人想要如鱼得水,学会Python应当提上日程。

这也是我想把风变编程-python小课推荐给大家的原因。它家做的是针对小白的Python课程,每天抽出半小时,0基础就能入门。

我去体验一下,结果打开了新世界的大门……

1> 直播步骤式实操了大量真实的场景案例,每次操作都会详细讲解步骤,跟着做你也可以用Python做出爬取、统计等作品。

2> 注重学员体验,不用打卡集赞,没有捆绑广告,助教也非常nice,我一有问题就会及时解答。

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    有用,学

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    2022-12-19 zhangzhaowei0123 来自浙江省

    很有用噢

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