生命活动的基础是生物分子间以及生物分子与其它分子间的相互作用，主要包括蛋白质-小分子、蛋白-蛋白相互作用、蛋白-核酸相互作用等。研究生物分子间的相互作用，可以从分子水平上了解生命现象，从而阐明生命活动的机理，发现致病机制、治疗途径以及新药研发，具有非常重要的理论和现实意义。随着生物分子相互作用实验技术平台的发展，积累了大量的分子互作实验数据，如何分析和处理这些数据成为关键。目前，用生物信息学的手段来研究生物分子相互作用显示出巨大的优势，技术工具更替升级的速度也越来越快。对从事基础研究的人员来说，迫切需要学习掌握生物信息学，生物分子互作等新工具，才有机会在科研竞争中占据优势。虚拟筛选是计算机辅助药物设计中十分重要的技术手段，能够从千万量级的化合物数据库中迅速筛选潜在的Hits，大大缩短发现先导药物的时间。经过多年的技术迭代，虚拟筛选领域积累了丰富的数据库和软件，我们的课程从理论到实际操作完美结合，让各位充分掌握相关软件操作的关键点。


授课对象：有生物分子互作分析需求的或者希望深入了解并掌握生物分子互作生物信息学分析数据库及工具的研究生、科研工作者。

学员基础：由于培训具备一定的深度和广度，我们希望学员应具有学习生物分子互作软件的兴趣、基本的生物概念和相关基础知识。
举 办 地：北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼

课程安排：2021年3月10-12日 上9：30-11：30 下13：30-17：00

主题

内容

备注

第一天

生物分子互作概述

1.生物分子相互作用概述

2.虚拟筛选：生物分子相互作用在计算机辅助药物设计方面的应用

理论+实操

基因信息和分子结构数据库

1.PDB：蛋白结构数据库及结构数据的筛选和获取

2.NCBI：生物信息综合数据库查询和数据获取

生物网络和疾病相关数据库

1.IPA：临床组学及药物数据挖掘

2.OMIM：人类疾病与基因遗传变异数据库

3.KEGG：细胞代谢及信号传导通路数据库

4.STRING：蛋白质互作网络查询和可视化分析

第二天

分子网络分析及可视化实操

1.Cytoscape：网络分析软件

2.生物分子交互作用复杂网络可视化

3.生物分子网络靶点分析、网络聚类分析

4.网络药理学论文实例概述

理论+实操

分子结构可视化软件SCI绘图实操

1.Pymol分子结构可视化软件

2.分子结构文件处理和计算

3.生物大分子靶点结构分析及高质量论文绘图

理论+实操

第三天

蛋白质靶点和小分子对接实操

1.Autodock软件原理及功能介绍

2.分子对接和对接结果分析

3.实例讲解与练习

理论+实操

虚拟筛选演示与实操

1.基于高性能计算集群的药物虚拟筛选概述2.ZINC：虚拟筛选小分子数据库介绍与应用

3.Autodock vina软件原理及功能介绍

4.实例讲解与练习

5.Linux介绍及高性能计算虚拟筛选操作演示

理论+实操

生物分子互作网络分析绘图及网络药理学介绍

1.大分子对接原理及应用介绍

2.Rosetta软件介绍与使用

3.z-dock软件介绍与使用

4.实例讲解与练习