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ATAC-seq<font color="red">技术</font>再升级：单分子<font color="red">测序</font>平台联手<font color="red">单细胞</font><font color="red">染色质</font><font color="red">可</font><font color="red">及</font><font color="red">性</font><font color="red">测序</font><font color="red">技术</font>

ATAC-seq技术再升级：单分子测序平台联手单细胞染色质可及性测序技术

基于二代测序平台(NGS)的scATAC-seq技术利用Tn5酶的DNA随机打断功能，可以富集染色质局部开放区域上的基因组DNA短片段（通常80-300 bp），这些短片段被当作开放染色质的信号。

iNature - ATAC-seq技术再升级，单分子测序，单细胞染色质可及性测序技术 - 2022-11-13

GENOME BIOLOGY：scIBD用于增强<font color="red">单细胞</font><font color="red">染色质</font><font color="red">可</font><font color="red">及</font><font color="red">性</font><font color="red">测序</font>中异型双联体的检测

GENOME BIOLOGY：scIBD用于增强单细胞染色质可及性测序中异型双联体的检测

对各种模拟和真实数据集的全面基准测试证明了 scIBD 的卓越性能和稳健性。

MedSci原创 - 单细胞染色质，单细胞染色质可及性测序技术，scIBD，异型双联体 - 2023-10-11

Front Immunol：<font color="red">单细胞</font>分辨下系统<font color="red">性</font>红斑狼疮患者外周血单核<font color="red">细胞</font><font color="red">染色质</font><font color="red">可</font><font color="red">及</font><font color="red">性</font>的研究

Front Immunol：单细胞分辨下系统性红斑狼疮患者外周血单核细胞染色质可及性的研究

系统性红斑狼疮(SLE)是一种多种免疫细胞参与的自身免疫性疾病。我们的目标是在单细胞分辨率下揭示SLE患者外周血单个核细胞(PBMC)染色质的可及性，并识别可能驱动异常免疫反应的转录因子(TF)。

MedSci原创 - 系统性红斑狼疮，外周血单核细胞，染色质可及性，单细胞分辨 - 2022-03-18

Nature：樊荣团队发表空间分辨<font color="red">测序</font>新<font color="red">技术</font>，首次实现小鼠和人类组织原位<font color="red">染色质</font><font color="red">可</font><font color="red">及</font><font color="red">性</font>分析

Nature：樊荣团队发表空间分辨测序新技术，首次实现小鼠和人类组织原位染色质可及性分析

该合作团队新开发的Spatial-ATAC-seq这一基于新一代测序技术的全新空间组学技术，可用于分析完整组织切片的染色质可达性，同时保留空间信息。

测序中国 - 新一代测序技术 - 2022-08-28

Genome Biology：scIBD：识别<font color="red">单细胞</font><font color="red">染色质</font>开放<font color="red">性</font><font color="red">测序</font>数据中异质双联体<font color="red">细胞</font>的新工具

Genome Biology：scIBD：识别单细胞染色质开放性测序数据中异质双联体细胞的新工具

厦门大学王颖、南开大学陈盛泉课题组联合开发了一个对不同单细胞染色质开放性测序数据，进行异质双联体细胞有效识别并去除的新工具。

测序中国 - 单细胞染色质，双联体细胞 - 2023-11-08

Nature：钟声课题组创新开发<font color="red">单细胞</font>多组学<font color="red">技术</font>MUSIC，同步分析多重<font color="red">染色质</font>相互作用、基因表达和RNA-<font color="red">染色质</font>关联

Nature：钟声课题组创新开发单细胞多组学技术MUSIC，同步分析多重染色质相互作用、基因表达和RNA-染色质关联

加州大学圣地亚哥分校钟声课题组开发了一种创新的单细胞多组学核酸分析技术MUSIC，可用于同时分析单个细胞核内的多重染色质相互作用、基因表达和RNA-染色质关联。

测序中国 - MUSIC，RNA-染色质 - 2024-04-25

当小鼠胚胎长出额外的双腿：揭秘胚胎发育中的<font color="red">染色质</font><font color="red">可</font><font color="red">及</font><font color="red">性</font>变化

当小鼠胚胎长出额外的双腿：揭秘胚胎发育中的染色质可及性变化

研究人员成功地创造了一种六腿小鼠胚胎，这一发现不仅令人惊讶，也为我们进一步理解生物体发育过程中基因路径(gene pathway)的作用提供了宝贵的信息。

生物探索 - 染色质，胚胎发育，小鼠胚胎 - 2024-04-05

Nat Commun：循环CD8+T<font color="red">细胞</font>的<font color="red">染色质</font><font color="red">可</font><font color="red">及</font><font color="red">性</font>预测胃癌患者对抗PD-1疗法的应答

Nat Commun：循环CD8+T细胞的染色质可及性预测胃癌患者对抗PD-1疗法的应答

关于持续性抗原刺激（如慢性病毒感染和肿瘤）引起的免疫细胞衰竭和肿瘤浸润淋巴细胞（TIL）功能障碍的研究显示，细胞表面蛋白与免疫细胞的功能受损有关。

MedSci原创 - 胃癌，抗PD-1疗法，循环CD8+T细胞，染色质可及性 - 2021-02-18

华大基因开发新型空间<font color="red">染色质</font><font color="red">可</font><font color="red">及</font><font color="red">性</font><font color="red">测序</font>工具SCA-seq，以单分子分辨率捕获表观遗传信息同时解析基因组构象

华大基因开发新型空间染色质可及性测序工具SCA-seq，以单分子分辨率捕获表观遗传信息同时解析基因组构象

SCA-seq利用纳米孔技术对包含染色质可及性、CpG甲基化和染色质构象信息的长片段进行测序，在单分子分辨率上将染色质可及性和CpG甲基化映射到基因组空间结构，同时解析基因组构象。

测序中国 - 测序，空间染色质，SCA-seq - 2023-12-22

Nature子刊：郑科/倪挺/崔益强利用<font color="red">单细胞</font><font color="red">测序</font>分析揭示RNA结合蛋白DDX43调控精子变形中<font color="red">染色质</font>重塑的动态过程

Nature子刊：郑科/倪挺/崔益强利用单细胞测序分析揭示RNA结合蛋白DDX43调控精子变形中染色质重塑的动态过程

该研究发现了一个在精子变形染色质重塑中发挥重要作用的新基因，也为在单细胞水平上研究RNA结合蛋白如何协同调控细胞动态发育和转录组动态变化提供了新的研究范式。

iNature - 染色质重塑，DDX43 - 2023-05-04

Nature子刊：<font color="red">染色质</font><font color="red">可</font><font color="red">及</font><font color="red">性</font>改变在儿童B-ALL的发生、药物反应和耐药复发中的重要作用

Nature子刊：染色质可及性改变在儿童B-ALL的发生、药物反应和耐药复发中的重要作用

从染色质可及性的角度对复发B-ALL基因组特征进行分析，详细描绘了儿童 B-ALL 的染色质可及性图谱，发现了药物治疗相关的染色质可及性改变，并进一步确定了一组早期复发的 B-ALL 亚群。

儿童肿瘤前沿 - B细胞急性淋巴细胞白血病 - 2023-10-31

Cell Rep| 乳腺癌<font color="red">细胞</font>可塑性和异质<font color="red">性</font>，<font color="red">单细胞</font><font color="red">染色质</font>可接近<font color="red">性</font>图谱揭示乳腺<font color="red">细胞</font>发育中<font color="red">细胞</font>状态特异性转录因子网络和<font color="red">细胞</font>谱系关系

Cell Rep| 乳腺癌细胞可塑性和异质性，单细胞染色质可接近性图谱揭示乳腺细胞发育中细胞状态特异性转录因子网络和细胞谱系关系

乳腺癌是全世界妇女中最常见的癌症，大约每年两百多万女性受其困扰。根据WHO 估计，在所有的女性癌症者中，约15%的死亡与乳腺癌相关。乳腺癌中某些类型至今仍然没有有效治疗方案。乳腺癌中癌细胞的可塑性和组织的异质性是治疗失败的一大原因。不论是乳腺发育过程中的正常乳腺细胞，还是乳腺癌发展过程中的癌细胞，对于其细胞状态转换的分子机制，人们的了解目前仍然十分有限。

BioArt - 乳腺癌，单细胞染色质，特异性转录，细胞谱系关系 - 2019-10-13

Cell Res：北京大学汤富酬团队开发用于单个<font color="red">细胞</font>内多组学分析的长读<font color="red">单细胞</font><font color="red">测序</font>方法

Cell Res：北京大学汤富酬团队开发用于单个细胞内多组学分析的长读单细胞测序方法

该研究报道了一种用于单个细胞内多组学分析的长读单细胞测序方法，scNanoCOOL-seq。

iNature - 长读单细胞测序，scNanoCOOL-seq - 2023-09-15

Front Immunol：强直性脊柱炎患者外周血单个核<font color="red">细胞</font>的整合<font color="red">单细胞</font>RNA-SEQ和ATAC-SEQ分析

Front Immunol：强直性脊柱炎患者外周血单个核细胞的整合单细胞RNA-SEQ和ATAC-SEQ分析

该研究集中在T细胞如何参与AS的发病机制，这将丰富AS单细胞研究的数据，为理解AS的发病机制提供新的视角。

MedSci原创 - 强直性脊柱炎，整合单细胞RNA-SEQ，ATAC-SEQ - 2022-02-19

CIRCULATION：主动脉瘤和解剖中平滑肌<font color="red">细胞</font>表型改变的表观遗传诱导

CIRCULATION：主动脉瘤和解剖中平滑肌细胞表型改变的表观遗传诱导

本研究揭示了AAD中SMC表型改变的动态表观遗传诱导，DNA损伤和细胞质渗漏驱动SMCs从收缩表型到炎症表型。

MedSci原创 - 2023-08-11

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