JCLA:如何尽量减少来自基因组DNA的cfDNA污染?
在本研究中,我们研究了三种血细胞收集管(BCTs)在预防白细胞破裂引起的基因组DNA污染方面的能力,并结合高灵敏度突变检测技术对其性能进行了评估。
网络 - 检测,基因组DNA - 2019-06-06
Nature | 超6万人全基因组序列分析结果揭示:线粒体DNA插入人类基因组从未停止
通过大规模的研究结合多层面的基因组数据,并根据NUMT的大小和基因组位置,研究团队绘制了一个高度异质性和动态的人类NUMT图谱。
测序中国 - 线粒体DNA,人类基因组,PR结构域锌指蛋白 - 2023-03-11
Genes Dev:美科学家绘制全基因组DNA修复图谱
利用化疗药物cisplatin或oxaliplatin杀伤癌细胞,会造成DNA损伤,因此癌细胞就不能够进行正常的DNA复制。但癌细胞仍然有各种方式进行DNA损伤修复,这直接导致癌症化疗药物不能高效发挥作用,满足病人需求。 近日,来自美国的科学家开发出一种方法,能够在全基因组范围内精确定位DNA损伤修复位点。这一研究进展发表在国际学术期刊Genes & Developm
生物谷 - 癌细胞,DNA - 2015-05-07
CLIN CHEM:羊水胎儿基因组的全基因组测序和分析
羊膜穿刺术是一种常见的手术,其主要目的是从胎儿收集细胞对异常染色体、染色体拷贝数的改变、少量单基因至多基因缺陷进行测试,。在这里,研究人员展示了从羊水样品的细胞或游离DNA(cfDNA)对胎儿进行精确全基因组分析的可行性。使用Complete Genomics nanoarray平台,对从31个羊膜组织中分离出的cfDNA和DNA进行测序,基因组覆盖率为50×。在一部分样品中,从分离自细胞
MedSci原创 - 羊水,胎儿,基因组 - 2018-04-04
NATURE:全基因组测序发现,自闭症中存在大量DNA重复序列
串联DNA重复在每个单元(motif)的大小和序列都不同。增多的串联DNA已与40多种单基因疾病相关。但是,至今为止,关于它们是如何参与复杂疾病的在很大程度上仍然是未知的。
MedSci原创 - 自闭症,重复序列 - 2020-07-28
IT顶尖学者Jaenisch实验室《Cell》发布基因组DNA甲基化编辑技术
生物谷 - 转化医学 - 2016-09-23
Blood:保护造血系统基因组和功能完整性需要耐受DNA氧化损伤。
内源性DNA损伤与干细胞功能减退和转化相关,标志着衰老。未被修复的DNA损伤会导致复制紧张和染色体断裂,进而引起细胞衰老和凋亡。至于干细胞和祖细胞如何处理累积的内源性DNA损伤,而这些又如何影响到细胞和组织的生理机能均尚不清楚。
MedSci原创 - 基因组,DNA氧化损伤,造血系统,DNA修复 - 2017-08-22
国家基因组科学数据中心首次公开新型冠状病毒全基因组序列
国家基因组科学数据中心(NGDC)信息显示,1月26日,该中心收录了由中国医学科学院/北京协和医学院病原生物学研究所提供的5株2019新型冠状病毒全基因组序列。
澎湃新闻 - 新型冠状病毒,全基因组序列 - 2020-01-30
为你的基因组测序
世界领先基因测序公司Illumina的首席执行官(CEO)声称,他晓得了如何让消费者对基因测序感兴趣:创建一个庞大的APP应用商店来储存基因信息。据报道,Illumina近日与美国华平投资集团和苏特—希尔投资公司合作为一个叫做“Helix”(意为“螺旋”)的公司注资1亿美元,这家公司的目的是让基因测序进入互联网的主流。开一家基因测序APP商店 很多科技公司都对基因组的价值怦然心动,I
生物谷 - 基因测序,基因商店 - 2015-09-09
全基因组重亚硫酸盐测序(whole genome bisulfite sequencing)用于全基因组DNA甲基化检测
表观遗传学研究已经证实了特定基因区域的DNA甲基化修饰对于染色体构象、基因表达调控机制有着重要影响,而全基因组DNA甲基化研究将是表观基因组学最为关注的内容之一。Bisulfite处理能够将基因组中未发生甲基化的C碱基转换成U,进行PCR扩增后变成T,与原本具有甲基化修饰的C碱基区分开来,再结合高通量测序技术,可绘制单碱基分辨率的全基因组DNA甲基化图谱。
MedSci原创 - DNA甲基化,基因组 - 2014-02-05
蛋白质基因组学:运用蛋白质组技术注释基因组
随着高通量DNA测序技术的飞速发展,越来越多的物种完成了基因组测序.定位编码基因、确定编码基因结构是 基因组注释的基本任务,然而以往的基因组注释方法主要依赖于DNA及RNA序列信息.为了更加精确地解读完成测序的基因组,我们需要整合多种类型的组学数 据进行基因组注释.近年来,基于串联质谱技术的蛋白质组学已经发展成熟,实现了对蛋白质组的高覆盖,使得利用串联质谱数据进行基因组注释成为可
生物化学与生物物理学进展 - 亚硝基化谷胱甘肽还原酶,GSNOR,NO,炎症因子 - 2014-01-03
Nat Commun:飞蝗全基因组序列被破译 暂为最大动物基因组
来自中国科学院动物研究所康乐院士领衔的团队、深圳华大基因研究院等单位的科研人员成功破译了迄今为止最大的动物基因组——飞蝗全基因组序列图谱,为揭示蝗灾暴发机制,开发可持续性治理策略及新的控制方法提供了宝贵的遗传资源
MedSci原创 - 基因组,飞蝗 - 2014-01-19
把基因组上传到云端
近日,Google正式推出了Google Genomics,这一产品可以让科学家把基因组数据存储在云端,并对DNA序列进行研究和共享。凭借这些,Google可以将DNA数据存储在自己的服务器集群上,并利用这些数据进行实验。其中用到的数据库技术与Google索引和用户
果壳网 - 基因治疗 - 2014-11-11
Cell:癌症基因组沉思录
癌症基因组沉思录近日,哈佛麻省Broad研究院的著名遗传学家Eric S.Lander教授与另外一位学者完成了题为“Lessons from the Cancer Genome”的文章,介绍了癌症基因组的系统性研究进展,概况了在细胞信号传导,染色体和表观遗传调控等方面发现的新癌基因Lander 教授是Broad医学院的创始人之一,人类基因组计划领导者之一
生物360 - Cell,癌症,基因组 - 2013-05-10
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