笔记收藏：影像组学/放射组学
近期在不同的学术会议上，有幸聆听学习了几位影像组学的大咖做报告，受益匪浅。以大咖们的报告为指导，自己也学习查找了一些文献，加入了一点点自己的理解和想法，整理成一篇笔记，与大家分享。名词解释：影像组学（Radiomics) “影像组学”，一共4个字，每个字都是常见字啊。但4个字放一起啥意思？好吧，我们把它们拆成“影像”和“组学”两个词来说。这里的“影像”通常指的就是放
MedSci原创 - 影像组学，放射组学 - 2018-07-25
Nat Biotechnol发表新空间组学方法，同步实现转录组和代谢组的空间多模态精确分析
研究团队证明了在单个组织切片中结合SRT和MALDI-MSI并保留两种模式的特异性和敏感性的可能性，并在多巴胺和帕金森病条件下的小鼠和人类大脑样本中证明了该方法的潜力。
测序中国 - 空间多模态精确分析 - 2023-10-03
Nat Rev Microbiol：宏基因组关联分析与微生物组
我们体内生活着不计其数的微生物，它们组成的生态系统就是微生物组。近年来人们发现这些微生物对人体健康有着重要的影响，微生物组研究因此受到了极大的重视，甚至被称为是人体的“第二基因组”。宏基因组关联分析（Metagenome-wide association studies,MWAS）是挖掘微生物组宝藏的有力工具，可以高分辨率研究微生物组与复杂疾病的关联，比如二型糖尿病、肥胖症、肝硬化
MedSci原创 - 宏基因组，关联分析，微生物组 - 2016-07-13
美国启动“国家微生物组计划”---详解“微生物组”来龙去脉
国家微生物组计划（National Microbiome Initiative，简称NMI） 2016年5月13日，美国白宫科学和技术政策办公室（OSTP）与联邦机构、私营基金管理机构一同宣布启动“国家微生物组计划”（National Microbiome Initiative，简称NMI），这是奥巴马政府继脑计划、精确医学、抗癌“登月”之后推出的又一个重大国家科研计划。
MedSci原创 - 微生物组，美国 - 2016-05-17
CLIN CHEM：羊水胎儿基因组的全基因组测序和分析
使用Complete Genomics nanoarray平台，对从31个羊膜组织中分离出的cfDNA和DNA进行测序，基因组覆盖率为50×。在一部分样品中，从分离自细胞
MedSci原创 - 羊水，胎儿，基因组 - 2018-04-04
国际人类表型组计划启动
由复旦大学牵头，中科院上海生命科学研究院、上海交通大学、上海市计量测试技术研究院的专家共同承担，投资近5.6亿元的上海市首批市级科技重大专项“国际人类表型组计划（一期）”项目3月25日在上海市启动。据悉，该项目标志性成果将是绘制第一张中国人全表型组参比图谱，为制定中国人健康标准提供依据。
健康报 - 人类表型组，启动，上海 - 2018-03-27
免疫组化系列 || Vimentin
Vim是细胞中5个主要中间丝（细胞角蛋白、波蛋白、结蛋白、神经丝蛋白、胶质纤维酸性蛋白）之一，分布最广泛，表达于间叶细胞及其起源的肿瘤，并在许多上皮细胞和肿瘤中与角蛋白共表达。
病理小贴士1973 - 免疫组化，波形蛋白，Vimentin - 2024-01-31
Nat Commun：前列腺癌整体蛋白组学分析揭示了疾病恶化过程中基因组和转录组的变异
为了理解前列腺癌中基因和转录变异在功能上影响的结果，就需要对在疾病形成和恶化期间蛋白组的变化情况进行阐释。
MedSci原创 - 前列腺癌，蛋白组学，变异 - 2018-03-26
JCF：CARRESS-HF研究着眼于超滤治疗在急性失代偿期心力衰竭患者中的运用
心肾综合征是一种因一个器官急性或慢性功能障碍所致另一个器官的急性或慢性功能障碍的综合征。心肾综合征中被广泛认知的一个亚型是在急性失代偿性心力衰竭（AHDF）的过程中出现的肾脏损伤，通常以急症治疗开始后出现或恶化的肾功能异常为表现。恶化的肾功能是指肌酐值较基线升高大于等于0.3mg/dl，在急性失代偿性心力衰竭中的发生率为20%～30%，常导致住院时间延长、再入院甚至死亡。近期的一些观察结果却发现肾
丁香园 - 超滤治疗，急性失代偿期，心力衰竭 - 2013-04-22
蛋白质基因组学：运用蛋白质组技术注释基因组
随着高通量DNA测序技术的飞速发展，越来越多的物种完成了基因组测序．定位编码基因、确定编码基因结构是 基因组注释的基本任务，然而以往的基因组注释方法主要依赖于DNA及RNA序列信息．为了更加精确地解读完成测序的基因组，我们需要整合多种类型的组学数 据进行基因组注释．近年来，基于串联质谱技术的蛋白质组学已经发展成熟，实现了对蛋白质组的高覆盖，使得利用串联质谱数据进行基因组注释成为可
生物化学与生物物理学进展 - 亚硝基化谷胱甘肽还原酶，GSNOR，NO，炎症因子 - 2014-01-03
NEJM：基因组和外显子组测序的临床指南
谁也没想到基因组测序技术这么快就进入了临床实践。现在，已经不少医生在测序的帮助下解决了之前难以确诊的疾病，尤其是罕见的儿童疾病。“这篇文章为医生们提供了可以遵循的基本准则，”美国国立人类基因组研究所（NHGRI）的主管EricD. Green博士说。文
MedSci原创 - 外显子，测序，临床指南 - 2014-07-03
国家基因组科学数据中心：整合中国组学资源，打破数据孤岛
用好科技资源 支撑创新发展2018年、2019年连续两年，组学数据库权威杂志《核酸研究》对前一年的全球基因组数据库建设进行总结，鲜见地在美英两个老牌的数据库以外，提到了中国的GSA（组学原始数据归档库）
科技日报 - 医学人文 - 2019-11-20
脊柱肿瘤研究学组（SORG）评估系统
脊柱肿瘤 - 2024-02-10
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