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Science:开发出TT-<font color="red">Seq</font>技术绘制人类瞬时转录组图谱

Science:开发出TT-Seq技术绘制人类瞬时转录组图谱

基因之间的序列长期以来被视为“垃圾DNA”,我们如今知道它们也发挥着至关重要的功能。这些DNA区域发生的突变能够严重地对人类发育造成损害,而且可能在生命后期导致严重疾病。然而,在此之前,调节性DNA序列一直很难发现。如今,在一项新的研究中,德国慕尼黑理工大学计算生物学教授Julien Gagneur团队和德国马克斯普朗克生物物理化学研究所教授Patrick Cramer团队如今开发出一种方法可

生物谷 - TT-Seq技术,人类瞬时转录 - 2016-06-04

重磅 | 人人可及,时空组学技术Stereo-<font color="red">seq</font>再次升级

重磅 | 人人可及,时空组学技术Stereo-seq再次升级

重磅 | 人人可及,时空组学技术Stereo-seq再次升级

网络 - 2022-11-04

Nucleic Acids Res:Tn-<font color="red">Seq</font>数据统计方法新进展

Nucleic Acids Res:Tn-Seq数据统计方法新进展

近期,Nucleic Acids Res中一篇文章指出,Tn-Seq数据统计方法有了新进展。Tn-Seq是一种通过对复杂的随机转座子插入库的构造,来探索基因功能的实验方法;通过使用新一代的测序技术,对每一个突变的度进行量化。识别基因的相互作用是Tn-Seq的一项新兴应用,这包含了在不同遗传背景下进行Tn突变库的比较(例如野生型菌株与敲除型的比较)。为了识别基因间的相互作用,提出几种Tn-Seq数据

MedSci原创 - Tn-Seq,量化,基因 - 2017-03-25

利用<font color="red">RNA</font>核酶复制和扩增<font color="red">RNA</font>

利用RNA核酶复制和扩增RNA

RNA自我复制是RNA世界假说的一个关键部分,但是在实验室中产生能够合成、复制和扩增功能性RNA分子的核酶(ribozyme)一直是比较困难的。在此之前,最为成功的I类RNA聚合酶核酶变异体即便在它们偏好的模板---短的简单的富含嘧啶碱基的RNA序列---上,工作效率并不高效。

生物谷 - RNA核酶 - 2016-08-17

STM封面:测序方法TEC <font color="red">SEQ</font>让癌症的血液检测又往前一步

STM封面:测序方法TEC SEQ让癌症的血液检测又往前一步

为了实现无创的方法早期检测癌症,Johns Hopkins Kimmel癌症中心的科学家报道他们已经开发了一个能测试血液中微量肿瘤特异性DNA的检测,已经用它来准确识别138人中超过一半患有相对早期的结直肠癌、乳腺癌、肺癌和卵巢癌。科学家说,这项试验的创新之处是它能区分肿瘤脱落的DNA和其它被误认为是癌症生物标记的DNA。

生物探索 - STM,测序,血液,癌症 - 2017-08-18

亲,带你认识<font color="red">RNA</font>军团中“非正规军”——非编码<font color="red">RNA</font>

亲,带你认识RNA军团中“非正规军”——非编码RNA

六十年前,弗朗西斯·克里克(Francis Crick)的“中心法则”( DNA转录成RNA,再翻译成蛋白质)现在一直是细胞作战的绝对军规,军事机密(遗传信息)必须从司令DNA先到RNA军团,再到“武

检验医学网 - 非编码RNA - 2020-05-13

<font color="red">RNA</font>靶向基因激活疗法

RNA靶向基因激活疗法

RNA靶向疗法通过选择性调节内源性RNA介导的细胞机制(如转录、剪接、翻译、mRNA稳定性和亚细胞定位)增强蛋白质生产的能力。

小药说药 - NBT,RNA靶向疗法 - 2023-06-08

<font color="red">RNA</font>剪接失调与癌症

RNA剪接失调与癌症

RNA剪接失调是几乎所有肿瘤类型的分子特征。癌症相关的剪接改变既来自反复突变,也来自调控剪接催化的反式作用因子的表达改变。

小药说药 - RNA,剪接 - 2023-01-18

迎接<font color="red">RNA</font>疗法的时代

迎接RNA疗法的时代

RNA为基础的疗法逐渐成为各种疾病的潜在干预策略。

网络 - 癌症治疗,SiRNA疗法 - 2023-03-17

Genome Biol | scRNA-<font color="red">seq</font>辅助分析新方法scGWAS,揭示性状-细胞类型关联图谱

Genome Biol | scRNA-seq辅助分析新方法scGWAS,揭示性状-细胞类型关联图谱

单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术可以定量测量单个细胞的基因表达,能够检测细胞类型特异性的转录组特征,为解码复杂疾病中由遗传介导的细胞类型特异性提供了独特的机会。

测序中国 - 单细胞RNA测序,细胞类型来进行性状,胰腺和免疫系统的细胞 - 2022-11-18

Nat Biotechnol:解析单细胞组蛋白修饰动态关系的新方法:scChIX-<font color="red">seq</font>

Nat Biotechnol:解析单细胞组蛋白修饰动态关系的新方法:scChIX-seq

在不同细胞群中表征不同组蛋白修饰的大规模研究工作通常使用染色质免疫沉淀测序法(ChIP-seq)来完成,但每个单细胞只能检测一个组蛋白修饰。

测序中国 - 单细胞组蛋白,蛋白修饰抗体 - 2023-02-06

Genome Biol:RNA印记法(RNA footprinting)用于转录组分析

生物学家们逐渐意识到,RNA不只是DNA和蛋白之间的过渡产物,它对调节基因的表达有重要作用。深入研究RNA调控,能够帮助科学家们进一步理解相关疾病。宾夕法尼亚大学的科学家们开发了分析RNA调控的新方法,这一方法能够有效获得RNARNA结合蛋白(RBP)互作的所有位点。这一发表在Genome Biology杂志上的文章,不仅鉴定了RBP结合位点中的重要基因突变,还为其他RNA研究者提供了路线图。

MedSci原创 - 印记,RNA印记 - 2014-01-10

甲基化DNA免疫共沉淀测序原理及简介(MeDIP-seq

MeDIP-Seq(Methylated DNA Immunoprecipitation Sequencing)测序是基于抗体富集原理进行测序的全基因组甲基化检测技术,采用甲基化DNA免疫共沉淀技术研究人员可以利用MeDIP-Seq

MedSci原创 - 甲基化,免疫共沉淀 - 2014-02-05

Genome Res:新的多重Digenome-seq工具让CRISPR-Cas9飞得更高

自从2013年1月首次用于基因组编辑以来,CRISPR-Cas9的知名度与日俱增。让它如此引人注目的原因在于它惊人的高效性和实用性;简而言之,它比较容易使用。去年,来自韩国基础科学研究所基因组工程中心的Jin-Soo Kim研究团队在Cell Stem Cell期刊上发表一篇标题为“Functional Correction of Large Factor VIII Gene Chromoso

MedSci原创 - CRISPR,工具 - 2016-02-06

2020 SEQ/SEMI/SEDAR临床实践指南:艰难梭菌感染的诊断和治疗建议

2020年2月,西班牙化疗学会(SEQ)联合西班牙内科学会(SEMI)、西班牙麻醉与复苏学会(SEDAR)共同发布了艰难梭菌感染的诊断和治疗建议,全文针对艰难梭菌感染的诊断和治疗的22个临床问题提出指导建议

Rev Esp Quimioter. 2020 Feb 20. - 艰难梭菌感染 - 2020-02-29

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