Science：揭示CLIP-170微管加快肌动蛋白丝延长机制
在一项新的研究中，来自美国布兰迪斯大学的一个研究小组证实在细胞中发现的CLIP-170微管（即结合着CLIP-170蛋白的微管）紧密地结合到蛋白formin上，从而加快肌动蛋白丝延长。该小组将一种荧光蛋白加入到这种微管中以便更好地理解蛋白CLIP-170在肌动蛋白丝组装中的作用。
生物谷 - CLIP-170，肌动蛋白 - 2016-05-22
Nature子刊 | 多用途深度学习方法sciPENN，可预测、插补scRNA-seq、CITE-seq蛋白质表达
综上所述，研究团队开发了sciPENN深度学习模型，可以预测和估算蛋白质表达，集成多个CITE-seq数据集，量化预测和估算不确定性。
测序中国 - sciPENN，、插补scRNA-seq，CITE-seq蛋白质表达 - 2022-11-24
Front Immunol：强直性脊柱炎患者外周血单个核细胞的整合单细胞RNA-SEQ和ATAC-SEQ分析
强直性脊柱炎(AS)是一种免疫介导的脊柱关节病。该研究集中在T细胞如何参与AS的发病机制，这将丰富AS单细胞研究的数据，为理解AS的发病机制提供新的视角。
MedSci原创 - 强直性脊柱炎，整合单细胞RNA-SEQ，ATAC-SEQ - 2022-02-19
Nature：非小细胞肺癌新靶点CLIP1-LTK被发现，劳拉替尼效果不错
据全球数据统计，在所有类型的癌症中，肺癌的死亡率最高，占癌症相关死亡的19%，占全球总死亡的3%。而非小细胞肺癌（NSCLC）约占肺癌总数的85%，是最常见的肺癌类型。
医药魔方Pro - 非小细胞肺癌，靶点 - 2021-12-12
Nature子刊：多用途深度学习方法sciPENN，可预测、插补scRNA-seq、CITE-seq蛋白质表达
研究团队开发了sciPENN深度学习模型，可以预测和估算蛋白质表达，集成多个CITE-seq数据集，量化预测和估算不确定性。
测序中国 - 基因测序，深度学习 - 2022-11-24
Science：开发出TT-Seq技术绘制人类瞬时转录组图谱
基因之间的序列长期以来被视为“垃圾DNA”，我们如今知道它们也发挥着至关重要的功能。这些DNA区域发生的突变能够严重地对人类发育造成损害，而且可能在生命后期导致严重疾病。然而，在此之前，调节性DNA序列一直很难发现。如今，在一项新的研究中，德国慕尼黑理工大学计算生物学教授Julien Gagneur团队和德国马克斯普朗克生物物理化学研究所教授Patrick Cramer团队如今开发出一种方法可
生物谷 - TT-Seq技术，人类瞬时转录 - 2016-06-04
Nucleic Acids Res:Tn-Seq数据统计方法新进展
近期，Nucleic Acids Res中一篇文章指出，Tn-Seq数据统计方法有了新进展。Tn-Seq是一种通过对复杂的随机转座子插入库的构造，来探索基因功能的实验方法；通过使用新一代的测序技术，对每一个突变的度进行量化。识别基因的相互作用是Tn-Seq的一项新兴应用，这包含了在不同遗传背景下进行Tn突变库的比较（例如野生型菌株与敲除型的比较）。为了识别基因间的相互作用，提出几种Tn-Seq数据
MedSci原创 - Tn-Seq，量化，基因 - 2017-03-25
SCI REP：利用 RNA-Seq 鉴别细菌和病毒感染
近日，国际杂志 《SCI REP》在线发表一项关于利用 RNA-Seq 鉴别细菌和病毒感染的研究。
MedSci原创 - 感染，细菌 - 2017-08-06
CLIP-seq—动物miRNA靶基因筛选新方法
CLIP-seq，即紫外交联免疫沉淀结合高通量测序(crosslinking-immunprecipitation and high-throughput sequencing),是一项在全基因组水平揭示
MedSci原创 - CLIP-seq，miRNA - 2014-01-10
利用Perturb-Seq和CRISP-Seq大规模平行分析数以万计基因扰动
单细胞筛选：一种向导RNA（gRNA）文库---每个gRNA靶向一个独特的基因用于CRISPR干扰，并且携带一种独特的条形码序列---被导入一个细胞群体中，这个细胞群体的密度确保一个gRNA平均进入一个细胞中。单个细胞随后被分选到携带添加着独特条形码的polyT引物的液滴中，这些引物被用来提取细胞的mRNA。随后，对这些mRNA进行测序揭示出引入的基因突变（所引入的突变是由gRNA决
生物谷 - 基因扰动，CRISPR，Cas9，Perturb-Seq，CRISP-Seq，向导RNA，mRNA，条形码 - 2017-03-28
急性心肌梗死后心源性休克死亡风险评分(CLIP评分)
心肌梗死 - 2024-02-17
基于RNA-Seq的长非编码RNA（lncRNA）预测
当前lncRNA研究主要采用高通量RNA-Seq测序技术，并通过生物信息学方法对测序数据进行处理和分析，以挖掘其中lncRNA的序列、结构、表达及功
生物化学与生物物理学进展 - RNA-Seq，长非编码RNA - 2014-01-03
甲基化DNA免疫共沉淀测序原理及简介（MeDIP-seq）
MeDIP-Seq（Methylated DNA Immunoprecipitation Sequencing）测序是基于抗体富集原理进行测序的全基因组甲基化检测技术，采用甲基化DNA免疫共沉淀技术研究人员可以利用MeDIP-Seq
MedSci原创 - 甲基化，免疫共沉淀 - 2014-02-05
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