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STM封面:测序方法TEC <font color="red">SEQ</font>让癌症的血液检测又往前一步

STM封面:测序方法TEC SEQ让癌症的血液检测又往前一步

为了实现无创的方法早期检测癌症,Johns Hopkins Kimmel癌症中心的科学家报道他们已经开发了一个能测试血液中微量肿瘤特异性DNA的检测,已经用它来准确识别138人中超过一半患有相对早期的结直肠癌、乳腺癌、肺癌和卵巢癌。科学家说,这项试验的创新之处是它能区分肿瘤脱落的DNA和其它被误认为是癌症生物标记的DNA。

生物探索 - STM,测序,血液,癌症 - 2017-08-18

Nat Biotechnol:解析单细胞组蛋白修饰动态关系的新方法:scChIX-<font color="red">seq</font>

Nat Biotechnol:解析单细胞组蛋白修饰动态关系的新方法:scChIX-seq

在不同细胞群中表征不同组蛋白修饰的大规模研究工作通常使用染色质免疫沉淀测序法(ChIP-seq)来完成,但每个单细胞只能检测一个组蛋白修饰。

测序中国 - 单细胞组蛋白,蛋白修饰抗体 - 2023-02-06

Genome Biol | scRNA-<font color="red">seq</font>辅助分析新方法scGWAS,揭示性状-细胞类型关联图谱

Genome Biol | scRNA-seq辅助分析新方法scGWAS,揭示性状-细胞类型关联图谱

单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术可以定量测量单个细胞的基因表达,能够检测细胞类型特异性的转录组特征,为解码复杂疾病中由遗传介导的细胞类型特异性提供了独特的机会。

测序中国 - 单细胞RNA测序,细胞类型来进行性状,胰腺和免疫系统的细胞 - 2022-11-18

2020 <font color="red">SEQ</font>/SEMI/SEDAR临床实践指南:艰难梭菌感染的诊断和治疗建议

2020 SEQ/SEMI/SEDAR临床实践指南:艰难梭菌感染的诊断和治疗建议

2020年2月,西班牙化疗学会(SEQ)联合西班牙内科学会(SEMI)、西班牙麻醉与复苏学会(SEDAR)共同发布了艰难梭菌感染的诊断和治疗建议,全文针对艰难梭菌感染的诊断和治疗的22个临床问题提出指导建议

网络 - 艰难梭菌感染 - 2020-02-29

Blood:单细胞RNA-<font color="red">seq</font>可揭示非整倍体造血细胞的特异性转录本。

Blood:单细胞RNA-seq可揭示非整倍体造血细胞的特异性转录本。

癌细胞常发生染色体异常。特定的细胞遗传变异常可用于预测结局,特别是对于血液肿瘤,例如常发生于恶性髓性血液病的7号染色体的单倍体。一直以来,由于缺乏将非整倍体细胞与二倍体细胞区分的标志物,很难在细胞水平研究非整倍体对功能的影响。

MedSci原创 - 单细胞RNA-seq,造血细胞,单倍体 - 2017-10-15

Ann Rheum Dis:单细胞RNA-<font color="red">seq</font>分析揭示了人类骨关节炎的进展

Ann Rheum Dis:单细胞RNA-seq分析揭示了人类骨关节炎的进展

这项研究结果为软骨细胞分类学提供了新的见解,并为人类OA软骨再生的有效和功能性操作提供了潜在线索。

MedSci原创 - 骨关节炎,RNA-seq分析,软骨细胞,HTCs - 2018-07-24

Nat Commun:单细胞水平检测染色体外环状DNA多样性及复杂性的新工具scCircle-<font color="red">seq</font>

Nat Commun:单细胞水平检测染色体外环状DNA多样性及复杂性的新工具scCircle-seq

研究团队开发并验证了Circle-seq的单细胞应用scCircle-seq,该方法适用于非固定和固定的细胞或细胞核,包括从肿瘤活检组织中提取的细胞核。

测序中国 - Circle-seq,eccDNA - 2024-03-23

Nat Genet:基于健康单细胞参考图谱准确识别scRNA-<font color="red">seq</font>数据中疾病相关细胞状态

Nat Genet:基于健康单细胞参考图谱准确识别scRNA-seq数据中疾病相关细胞状态

研究团队评估了单细胞参考图谱的选择如何影响从疾病样本scRNA-seq数据中识别细胞状态变化。

测序中国 - scRNA-Seq,单细胞参考图谱 - 2023-11-17

INSERT-<font color="red">seq</font>方法可对DNA整合特征进行高分辨率定位

INSERT-seq方法可对DNA整合特征进行高分辨率定位

综上所述,INSERT-seq将基于扩增的富集、UMI扩增校正以及处理整合位点的计算框架相结合。

测序中国 - INSERT-seq方法,DNA整合特征,高分辨率定位 - 2022-11-28

Mol Cell:薛愿超团队开发CRIC-<font color="red">seq</font>技术,揭示PTBP1调控可变剪接新机制

Mol Cell:薛愿超团队开发CRIC-seq技术,揭示PTBP1调控可变剪接新机制

在哺乳动物细胞中,前体mRNA能够通过可变剪接产生多种异构体,以执行相似或不同的生物学功能。可变剪接的异常与恶性肿瘤和神经退行性疾病等重大疾病的发生密切相关。

“生物世界”公众号 - PTBP1,CRIC-seq技术 - 2023-03-27

ATAC-<font color="red">seq</font>技术再升级:单分子测序平台联手单细胞染色质可及性测序技术

ATAC-seq技术再升级:单分子测序平台联手单细胞染色质可及性测序技术

基于二代测序平台(NGS)的scATAC-seq技术利用Tn5酶的DNA随机打断功能,可以富集染色质局部开放区域上的基因组DNA短片段(通常80-300 bp),这些短片段被当作开放染色质的信号。

iNature - ATAC-seq技术再升级,单分子测序,单细胞染色质可及性测序技术 - 2022-11-13

基于英国“10万人基因组计划”转录组数据,揭示RNA-<font color="red">seq</font>对罕见疾病的诊断潜力

基于英国“10万人基因组计划”转录组数据,揭示RNA-seq对罕见疾病的诊断潜力

该研究对英国“十万人基因组计划”(UK100K)中一个大型患者队列的转录组数据进行了初步分析,揭示了RNA-seq在改善罕见疾病诊断方面的潜力。

测序中国 - RNA-Seq,RNA测序,罕见疾病 - 2023-06-28

Ann Rheum Dis:单细胞RNA-<font color="red">seq</font>分析可以识别半月板祖细胞并揭示半月板变性的进展

Ann Rheum Dis:单细胞RNA-seq分析可以识别半月板祖细胞并揭示半月板变性的进展

识别半月板祖细胞为基于细胞的半月板组织工程学提供了全新的角度,并证明了半月板变性的新机制,而这有助于开发新的治疗策略。

MedSci原创 - 半月板变性,单细胞RNA-seq分析,半月板祖细胞,DegP - 2020-01-07

2020 SEQ/SEMI/SEDAR临床实践指南:艰难梭菌感染的诊断和治疗建议

2020年2月,西班牙化疗学会(SEQ)联合西班牙内科学会(SEMI)、西班牙麻醉与复苏学会(SEDAR)共同发布了艰难梭菌感染的诊断和治疗建议,全文针对艰难梭菌感染的诊断和治疗的22个临床问题提出指导建议

Rev Esp Quimioter. 2020 Feb 20. - 艰难梭菌感染 - 2020-02-29

染色质免疫沉淀-测序(ChIP-seq):全基因组范围研究蛋白质-DNA相互作用的新技术

 染色质免疫沉淀-测序(ChIP-seq)是近年来新兴的将染色质免疫沉淀(ChIP)与深度测序技术相结 合,在全基因组范围内分析DNA结合蛋白结合位点、组蛋白修饰、核小体定位和DNA甲基化的高通量技术.在新一代测序(NGS)技术的大力推动 下,ChIP-seq提供了一种相对于ChIP-chip高分辨率、低噪音、高覆盖率的研究方法.随着测序成本的降低,ChIP-seq逐步成为研究基因

生物化学与生物物理学进展 - ChIP,seq,染色质免疫沉淀,基因组 - 2014-01-03

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